Εναλλακτικές διαδικασίες είναι εκείνες οι πρόσθετες δοκιμές ελέγχου που χρησιμοποιούνται όταν το αρχικό σύνολο προγραμματισμένων διαδικασιών ελέγχου δεν μπορεί να εκτελεστεί ή αποδειχθεί αναποτελεσματικό. Για παράδειγμα, ένας ελεγκτής αποστέλλει εισπρακτέες επιβεβαιώσεις στους πελάτες ενός πελάτη, αλλά υπάρχουν τόσο λίγες απαντήσεις που ο ελεγκτής πρέπει να χρησιμοποιήσει εναλλακτικές διαδικασίες, όπως η σύγκριση μεταγενέστερων εισπράξεων μετρητών με τα υπόλοιπα εισπρακτέων στο τέλος του έτους. Ομοίως, ένας ελεγκτής δεν είναι σε θέση να παρακολουθήσει τον αριθμό των φυσικών αποθεμάτων του πελάτη στο τέλος του έτους, και έτσι αποφασίζει να χρησιμοποιήσει μια εναλλακτική διαδικασία, η οποία ανιχνεύει τις μεταγενέστερες πωλήσεις τελικών αγαθών πίσω στα αρχεία απογραφής στο τέλος του έτους.
Μετά την εκτέλεση εναλλακτικών διαδικασιών, ο ελεγκτής πρέπει να καθορίσει εάν έχουν συγκεντρωθεί επαρκή πρόσθετα ελεγκτικά τεκμήρια. Εάν όχι, πρέπει να γίνουν περαιτέρω εναλλακτικές διαδικασίες. Μόλις ολοκληρωθούν όλες οι δοκιμές ελέγχου, ο ελεγκτής πρέπει να τις τεκμηριώσει στα έγγραφα εργασίας του ελέγχου.
