Υπάρχουν πολλαπλές διαφορές μεταξύ των λειτουργιών εσωτερικού ελέγχου και εξωτερικού ελέγχου, οι οποίες είναι οι εξής:
Οι εσωτερικοί ελεγκτές είναι υπάλληλοι της εταιρείας, ενώ οι εξωτερικοί ελεγκτές εργάζονται για εξωτερικό ελεγκτικό γραφείο.
Οι εσωτερικοί ελεγκτές προσλαμβάνονται από την εταιρεία, ενώ οι εξωτερικοί ελεγκτές διορίζονται με ψήφο των μετόχων.
Οι εσωτερικοί ελεγκτές δεν πρέπει να είναι CPA, ενώ ένα CPA πρέπει να διευθύνει τις δραστηριότητες των εξωτερικών ελεγκτών.
Οι εσωτερικοί ελεγκτές είναι υπεύθυνοι για τη διαχείριση, ενώ οι εξωτερικοί ελεγκτές είναι υπεύθυνοι έναντι των μετόχων.
Οι εσωτερικοί ελεγκτές μπορούν να εκδώσουν τα ευρήματά τους σε κάθε τύπο μορφής αναφοράς, ενώ οι εξωτερικοί ελεγκτές πρέπει να χρησιμοποιούν συγκεκριμένες μορφές για τις ελεγκτικές γνώμες και τις διαχειριστικές επιστολές τους.
Οι εκθέσεις εσωτερικού ελέγχου χρησιμοποιούνται από τη διοίκηση, ενώ οι εκθέσεις εξωτερικού ελέγχου χρησιμοποιούνται από ενδιαφερόμενους, όπως επενδυτές, πιστωτές και δανειστές.
Οι εσωτερικοί ελεγκτές μπορούν να χρησιμοποιηθούν για την παροχή συμβουλών και άλλης συμβουλευτικής βοήθειας στους υπαλλήλους, ενώ οι εξωτερικοί ελεγκτές δεν μπορούν να υποστηρίξουν έναν πελάτη ελέγχου πολύ στενά.
Οι εσωτερικοί ελεγκτές θα εξετάσουν ζητήματα που σχετίζονται με επιχειρηματικές πρακτικές και κινδύνους της εταιρείας, ενώ οι εξωτερικοί ελεγκτές εξετάζουν τα οικονομικά αρχεία και εκδίδουν γνώμη σχετικά με τις οικονομικές καταστάσεις της εταιρείας.
Οι εσωτερικοί έλεγχοι διενεργούνται καθ 'όλη τη διάρκεια του έτους, ενώ οι εξωτερικοί ελεγκτές διενεργούν έναν ενιαίο ετήσιο έλεγχο. Εάν ένας πελάτης είναι δημόσιος, εξωτερικοί ελεγκτές θα παρέχουν επίσης υπηρεσίες ελέγχου τρεις φορές το χρόνο.
Εν ολίγοις, οι δύο συναρτήσεις μοιράζονται μια λέξη στα ονόματά τους, αλλά διαφορετικά είναι εντελώς διαφορετικές. Οι μεγαλύτεροι οργανισμοί έχουν συνήθως και τις δύο λειτουργίες, διασφαλίζοντας έτσι ότι τα αρχεία, οι διαδικασίες και οι οικονομικές τους καταστάσεις εξετάζονται προσεκτικά σε τακτά χρονικά διαστήματα.
